建筑节能中心成立以来，结合实际情况，逐步形成了一套合理、完善、良好的组织、管理体系。
建筑节能中心实行院、部门二级管理。中心在学院建设领导小组的统一部署、统筹规划下，以各项目课题组的形式开展科研工作，由中心负责项目立项申请，课题组进行项目研究和推广实施，以保证中心工作的协调和日常运行管理。
建筑节能中心的管理实行主任负责制，并配置相应的科研人员和办公室人员，具体负责中心的各项工作，建立科学、有效的队伍建设、人员管理、设备管理制度，有明确的岗位职责及分工细则，有严格的考核办法和奖惩制度。中心科技人员要本着实事求是和严谨务实的工作态度，准确把握节能工作的重点，富有责任心地及时完成各项工作。